大多人都知道認定高新技術企業(yè)真的是好處多多。相比普通企業(yè)來說，高新技術企業(yè)所得稅15%低稅率優(yōu)惠，并且減免40%，而普通企業(yè)所得稅稅率為25%，這一項稅收優(yōu)惠就已經(jīng)令很多企業(yè)望塵莫及了。再例如，高新技術企業(yè) 職工教育經(jīng)費支出，不超過工資薪金總額8%的部分，準予稅前扣除，而普通企業(yè)的扣除比例為2.5%；并且中小高新企業(yè)轉增資本個人所得稅可以在5年之內(nèi)分期納稅，普通企業(yè)則必須當年繳納。另外對企業(yè)研發(fā)費用，按50%加計扣除或按照無形資產(chǎn)成本的150%攤銷、符合條件的技術轉讓所得可以減免企業(yè)所得稅，這兩項對所有企業(yè)都適用的稅收優(yōu)惠，更是讓高新技術企業(yè)占盡先機。
高新技術企業(yè)認定稅務風險
但是對取得高新技術企業(yè)資格且享受稅收優(yōu)惠的高新技術企業(yè)，稅務部門如在日常管理過程中發(fā)現(xiàn)其在高新技術企業(yè)認定過程中或享受優(yōu)惠期間不符合《認定辦法》第十一條規(guī)定的認定條件的，應提請認定機構復核。復核后確認不符合認定條件的，由認定機構取消其高新技術企業(yè)資格，并通知稅務機關追繳其證書有效期內(nèi)自不符合認定條件年度起已享受的稅收優(yōu)惠。

應對高新技術企業(yè)財務核算進行稅務合規(guī)性管理，需要重點關注幾大問題：
其一、高新技術政策與研發(fā)費加計扣除政策的區(qū)別，不要將兩者混淆，造成稅務風險；
其二、研發(fā)領料退回或者下腳料收入應沖減研發(fā)費用；
其三、按照企業(yè)所得稅匯算清繳申報表的條目單獨歸集研發(fā)費加計扣除的研發(fā)費；
其四、研發(fā)費加計扣除不再需要到科技部門立項，企業(yè)自主立項即可。